L1 S2 - CHIM 121 - BASES DE LA CHIMIE ORGANIQUE
COURS DE THIERRY BRIERE
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Pour pouvoir visualiser les molécules dans l’espace vous devez préalablement installer le plug-in CHIME de M.D.L
Vous trouverez sur la toile de nombreuses molécules au format PDB.
Les molécules utilisées dans ce cours ont pour la plupart cette origine.
Il est beaucoup plus simple de prendre une molécule existante et de la modifier, plutôt que d’en créer une nouvelle.
J’ai donc pris la liberté d’utiliser des molécules déjà existantes et de les modifier pour créer des molécules fictives, permettant une bonne compréhension du point étudié. D’autres molécules ont été utilisées telles quelles sans modifications. Je remercie les auteurs originaux des molécules utilisées de les avoir mises à disposition sur la toile.L’auteur original quand il est connu est cité dans l’entête du fichier texte correspondant. Citons les deux principaux contributeurs :
Dave Woodcoke et Gérard Dupuis. http://www.faidherbe.org/site/cours/dupuis/accueil.htm
Remarque : A cause de ces modifications, certaines longueurs de liaisons ou rayons atomiques ne sont pas respectés, ce qui ne gène en rien la compréhension mais pourrais surprendre le lecteur avertit.
COURS
PREMIERE PARTIE
L'ATOME DE CARBONE DANS TOUS SES ETATS
II-LE CARBONE TÉTRAGONAL OU CARBONE sp36
III.LE CARBONE TRIGONAL OU CARBONE sp2 9
IV.ISOMERIE E,Z DES ALCENES 13
V.REGLES DE CAHN, INGOLD ET PRELOG 17
VI.LE CARBONE DIGONAL OU CARBONE sp 19
DEUXIEME PARTIE : CONFORMATION ET CONFIGURATION
IV QUELQUES DÉFINITIONS PRÉALABLES
V LES CONFORMATIONS DE L'ETHANE :
VI LES CONFIGURATIONS DU PROPANE
VII LES CONFORMATIONS DU BUTANE
VIII CONFORMATIONS DES CYCLES :
IX ISOMERIE CIS-TRANS DES CYCLES
X CONDITIONS DE CHIRALITE D'UNE MOLECULE
XII DETERMINATION DES CONFIGURATIONS R et S
XIII DÉTERMINATION DES CONFIGURATIONS R OU S : CONFIGURATION R
XIV DÉTERMINATION DES CONFIGURATIONS R OU S : CONFIGURATION S
XV MOLECULES POSSEDANT PLUSIEURS CARBONES ASSYMETRIQUES